과거의 사고가 원인으로 특수한 신체능력을 가지게 된 고등학생 키사라기 타케루는 답답함을 느끼면서도 변함없이 현대사회에서 생활했다. 하지만 어느 날 집 창고에서 불가사의한 빛에 휩싸였고, 정신을 차리자 그곳은 마력을 증폭하는 장치로써 검이 세상을 지배하는 이세계였다……. 아연해 있던 타케루에게, 사쿠야라는 이름의 검은 머리, 검은 눈의 미소녀가 고했다. “이곳은 고도 1만 5천 미터에 떠 있는 세계 유일의 공중도시, 신역부유도시 - 에테르 플로트.” 각국의 초 엘리트가 모인 학교 『데우스아토르 아카데미아』를 무대로 펼쳐지는 학원 배틀 무쌍 환상곡, 시동! 「검기--해방―!」

예전에 신동이라 칭송받던 용사 시온은 마왕을 쓰러트리고 세상을 구했지만, 『마왕의 저주』 때문에 왕도에서 쫓겨나고 변경에서 은둔생활을 할 수밖에 없게 된다. 세상을 구했지만 세상에게 미움받는 소년은, 어느 날부터 네 명의 메이드 누나와 같이 살게 되는데...

이스루기 하루는 집안 사정으로 한때 사귀었던 소꿉친구이자 전 여친인 타마키 리오와 정략결혼을 하게 되었다. 한 지붕 아래, 형식뿐인 무미건조한 동거 생활을 보내려 하지만――실은 이 두 사람, 아직 서로에게 미련이 가득…….