지도에도 존재하지 않는 금지된 섬, 유사도. 유사도 근처 장마도에서 태어난 승호는 어렸을 때 그 섬에 대한 악몽 같은 기억을 가지고 있다. 기억하고 싶지 않았던 그 섬을 떠난 후, 우연히 대학교 동아리원들과 함께 고향 섬을 찾게 된다. 짝사랑하는 다희와 즐겁고 행복한 시간을 보낸 것도 잠시, 그녀와 친구들이 몰래 유사도에 들어갔다가 실종된 것을 알게 된다. 진실을 밝히고자 하는 성 형사의 도움으로 유사도와 그곳에 숨겨진 깨어나서는 안 될 끔찍한 존재에게 점점 다가가게 되지만, 모든 것을 숨기려고 하는 거대한 세력들이 이들 앞을 가로막는다. 과연 그들은 유사도와 그곳에 숨겨진 진실을 알아내고 깨어나서는 안 될 끔찍한 존재를 막을 수 있을까.
역신(疫神)은 역병의 신이라는 뜻으로 호환마마, 마마와 비슷한 전통적인 질병을 퍼뜨리는 악신을 의미한다.어느 날, 대동강 유역에서 발견된 작은 구체가 사람들의 손에 들어가면서 정체를 알 수 없는 치사율이 높은 급성 전염병이 퍼져나간다. 북한 정부가 외부와의 연결이 끊어지면서 미국과 남한 정부는 사태 파악 및 대처를 위해 북한으로의 침투를 결정한다. 블랙 3팀의 팀장 종석(두억)은 남한의 침투조를 맡게 되고, 미군과 교황청에서 비밀리에 파견된 수녀인 은영(아네스)이 일행에 합류하게 된다. 단순한 전염병이라고 생각했던 북한 내부의 상황은 심각했고, 그들은 사상 최악의 사태의 직면하게 되는데…….