“니케 학원에 오신 것을 환영합니다, 지휘관.”인카운터가 세계적인 콘텐츠로 발전한 것은 그리 오래된 이야기가 아니다. 인카운터는 랩쳐라 불리는 기계병을 총기와 로켓포 등으로 토벌하고, 기록을 경쟁하는 인기 경기다. 사람들의 마음을 사로잡고 세계에서 활약하는 톱 플레이어, 프로 니케를 목표로 이 학원에서는 매일 소녀들이 경쟁하며 실력을 키워나가고 있다. 그런 니케 학원에서 대량의 도난 사건이 발생?! 대체 누가, 무엇을 목적으로…?! 카운터스 세 명을 중심으로 니케들이 범인 찾기에 도전한다! 총격, 폭발, 뭐든지 있는 학원 코미디──!!