제731부대 출신 대원들, 군의관을 비롯해서 의사라든지 연구원 등은 그 죄과의 비중이 컸던 것과는 무관하게 종전이 된 후 전범으로 처벌받지 않았다. 처벌받기는커녕 그들은 제731부대에 있으면서 생체실험으로 연마한 기술을 바탕으로 눈부신 활약을 해서 유명한 학자나 의사가 되었다. 조사한 바에 의하면 유명한 심장전문의가 되기도 하고, 종합병원의 병원장이라든지 의과대학의 학장이 되어 있었다. 전후 일본 의학계에서 기라성 같은 업적과 명성을 떨치고 있었다. 연구원이 아닌 병사 출신의 일부 대원은 비참한 생활을 하기도 했지만 대부분 출세를 했다.